因殿中有馬蹄印而得名。石窟進深10米，寬10米，高３米，中心柱前上下開龕有兩排座佛像，上龕中有三世佛。即：過去佛燃燈佛、現(xiàn)在佛釋迦牟尼佛，未來佛彌勒佛。下龕塑有三尊頭戴桃形“班霞”金光燦燦的佛像。中間一尊是藏傳佛教格魯教派的創(chuàng)始人宗喀巴塑像，左邊是大弟子賈操杰，右邊是二弟子克珠杰，這三尊一級的塑像被格魯派人尊稱為“杰亞賽松”，意為父子三尊，極受藏傳佛教的尊崇。中心柱回廊四周，邊墻供臺上塑有藏傳佛教十六尊者，四大天王眾佛像。殿中的石地上有一馬蹄印跡，清晰可見，象真的馬蹄印，但又大于一般的馬蹄跡。馬蹄印的形成有不同的說法，一種說是神馬蹄跡，有次法顯路過到臨松峽谷馬蹄寺，一天下午，半天彩霞，忽見一匹神馬從北向東飛來，到寺院上空徘徊多次，被這神奇的地方吸引住，便落到一塊青石上，蒞臨這佛教圣地，后來在青石上留下一個馬蹄跡，這就是神馬蹄跡的說法；也有說是格薩爾座騎的蹄跡，格薩爾王從《霍嶺大戰(zhàn)》凱旋歸來，在千佛洞前的長頭灘安營扎寨，犒賞三軍將士，乘座騎前去檢閱大軍，戰(zhàn)馬一見到獵獵軍旗，氣壯山河的威武大軍，抑制不住其烈性，奮蹄疾馳，格薩爾忽然緊勒馬爵釵，戰(zhàn)馬因用過過猛，一只前蹄踏在一塊青石上，才站穩(wěn)身子，便留下了馬蹄印。馬蹄殿門口下方的石崖上至今還留有不少格薩爾系馬的小石孔，五十年代，這些石孔前還有一個格薩爾喂馬的馬槽，還有拴馬的１米多高的鐵橛，但你見到這些情景，不得不相信馬蹄殿中的“神驥足”就是格薩爾的馬蹄印。