能仁寺位于漣水縣城中山路西首，距淮安市-紀念館約30公里，南瀕碧波蕩漾的古黃河，東依風光旖旎的漣漪湖，西臨通貫南北的寧連高速公路，昔日譽為“漣水八大景點”之一。能仁寺始稱“文殊院”，后改“承天寺”（又名“承天院”），宋仁宗時易名為“能仁教寺”，簡稱“能仁寺”，此名一直沿用至今。該寺始建于唐初，距今至少有1300多年歷史；寺內妙通塔，始建于公元1023年，至今已有980多年歷史。

據(jù)清雍正本《安東縣志》載：“妙通塔，在能仁寺內，宋仁宗敕建，臥佛藏舍利處．．．．．．浮屠七級，皆磚石砌成，內中并無寸木支柱。頂上望黃河如線，間放光明，照耀數(shù)十里，遠近男婦皆見之，真法林之勝跡也?！绷頁?jù)康熙本《安東縣志》載：“能仁教寺，宋天圣元年敕建，舊名承天寺，即婁道者征道之所。祥符間賜額能仁寺，塔曰妙通，藏道者舍利?！笨梢?，

漣水妙通塔和能仁寺與一般塔、寺不同：一是由皇帝御賜名字和匾額，二是寶塔建筑結構工藝奇特。這些，都與宋時高僧婁道者的因緣經歷密切相關。

婁道者，姓婁，名守堅，他自號“道者”，世人便稱其為“婁道者”，宋初漣水丁湖口（今漣水紅窯鎮(zhèn)朱樓村庵圩組）人。生于宋太祖建隆元年（960年），圓寂于宋真宗乾興元年（1022年）。據(jù)天啟元年《淮安府志》本、清康熙三十七年《安東縣志》本、《證因大師成道記》等載，婁守堅出生時就有奇異征兆，因生性皮頑，“嬉笑無節(jié)，目大口方”，幼時即被鄉(xiāng)人稱為“彌勒佛”。少時隨父兄業(yè)漁，后被送承天寺為僧，通醫(yī)。在承天寺10多年-，能知人休咎，助人消災，一時名聲大振，遠播四方。祥符三年（1010年）五月朔，皇太子（即后來的宋仁宗）生，“晝夜啼，詔天下能止啼者”進宮診治，漣水承天寺僧人婁道者應詔，治好太子夜啼，真宗帝大喜，賜號“證因大師”，讓他回漣住持承天寺，并賜以御偈、金器等物，偈曰：“慧目朗然，燭天之秘。保朕皇儲，以克永世。號稱證因，恩光爾被。”

天禧五年(1021年)冬，泉州興化人方偕任漣水知軍，證因大師聞其不信佛事，便對徒弟說：“緣盡矣?！彼煊谇d元年（1022年）正月十一日“側臥而化”(世人因此亦尊稱其為“臥佛”)，鄉(xiāng)人將其衣物葬于古黃河側岸，名“臥佛崗”。又在寺內建小塔，將舍利藏于塔下。

宋仁宗天圣元年（1023年），仁宗誕日，太后語及止啼時事，仁宗便詔令道者，而此時道者已圓寂。仁宗感其恩，遂敕其家鄉(xiāng)漣水建塔，以藏臥佛舍利，賜名“妙通”，改“承天寺”為“能仁教寺”，并為道者加謚“蹈寶華如來”。

妙通塔與連云港阿育王塔同建于宋仁宗天圣元年（1023年），據(jù)民國時期留下的塔照及考證，其整體建筑遵循宋代《營造法式》的規(guī)制，結構嚴謹精巧，用材簡潔合理，是中國傳統(tǒng)建筑的樓閣式，高60多米，七級八面，內無寸木支柱，皆磚石砌成，巍峨雄偉，古樸凝重。地宮內的八角形塔基與藻井，方形宮室以及仿木建筑的倚柱、斗拱等，都具有宋代的形制特征。其主體風格與河南鄭州開元寺塔基、河北定縣靜志寺塔基相近，屬于宋代早期建筑。宋英宗治平四年（1067年），慶徽方將祖師證因的骨灰安葬于塔內。

1998年6月，挖掘妙通塔地宮時出土的石碑碑文載：“敕賜承天院造塔記

皇宋治平四年歲次丁未甲辰月辛亥日安葬/祖師證因大師婁道者磚塔內佛牙舍利具錄/宋朝宣賜金字牌院額事件等一奉兩朝/圣恩宣詔證因大師入內供養(yǎng)一奉太宗皇帝淳化三年正月內宣賜御制御書偈子一首/御制秘藏詮三十 卷御制逍遙詠一十一卷次遇/真宗皇帝于景德四年十一月內宣賜御制御書偈子二首并在本院收管永為紀錄?！弊C因大師，兩次奉詔“入內供養(yǎng)”，荼毗后，仁宗又為其建塔，并賜塔名和匾額。一個僧人，受到三朝皇帝如此尊崇，實屬罕見！

妙通古塔建成后，能仁寺亦整修一新，建有大雄寶殿、臥佛殿、韋馱殿、藏經樓、觀音閣等，氣象雄闊，美輪美奐。由于妙通塔是皇家敕建，藏有高僧舍利，能仁寺也就成了蘇北一方著名的叢林，從宋到清，高僧云集，群賢畢至，梵音余裊，香火鼎盛。明清時期著名禪宗大師嵩乳道密、南庵大依等都曾在這里進行過佛事活動。蘇東坡、米南宮及歷代漕撫、知府等的游足絡繹不絕，文人墨客留下的詩詞歌賦不勝枚舉，如明朝詩人王啟運《能仁寶塔》詩云：“中掛漣城半壁天，曉昏青鎖萬家煙。西歸臥佛何時醒，百丈浮圖斗氣連?！?/p>

能仁寺跨越千載，歷盡無數(shù)磨難。民國時期，戰(zhàn)爭頻仍。1946年，內戰(zhàn)爆發(fā)后，由師長張靈甫指揮的-王牌軍整編第七十四師兩次攻打漣水城，粟裕領導的華中野戰(zhàn)軍，憑借南門外的古黃河大堤和能仁寺中的妙通塔，與其決戰(zhàn)二十多個晝夜，致使七十四師傷亡慘重。據(jù)說張靈甫怪罪是妙通塔顯靈保佑了粟裕部隊，妙通塔因此名噪一時。根據(jù)長篇小說《紅日》改編的同名電影和電視劇，都有張靈甫在能仁寺妙通塔下留影的特寫鏡頭，給觀眾留下深刻印象。1948年7月，妙通塔不幸毀于兵燹，能仁寺也隨之消失。

1992年8月，漣水縣決定復建能仁寺、妙通塔。1998年6月，有關人員對妙通塔原址進行勘探，在塔下發(fā)現(xiàn)地宮。地宮為正方形，長寬約1.3米，高約2米。劵門朝南，高1.45米，寬0.5米，進內有七級踏步，里面三道拱門，最里一拱門只有0.536米高。地宮內四周有角柱，頂部有八角藻井，井中央鑲有一面直徑約0.25米的蓮花紋銅鏡，上刻銘文“千秋萬歲”。地宮北壁有供臺，臺上放置一石函，石函上雕刻有《高僧說法圖》等精美圖案。石函內隨葬有黃金鳳釵、水晶、瑪瑙和宋代青白瓷瓶、色彩斑斕的玻璃瓶及大量錢幣等。妙通塔地宮東側靠墻置造塔記碑一通，碑首題額“敕賜承天院造塔記”，碑上刻有碑文，清晰可辨。尤為珍貴的是，石函內有銀槨，銀槨內還放有一金棺，金棺內放有佛牙、舍利。同時還發(fā)現(xiàn)一圓形銀盒，里面放有骨灰。據(jù)清理情況分析，銀盒內的骨灰應是證因大師的“生身舍利”，金棺內的佛牙、舍利應是“法身舍利”。海內外媒體對此作了廣泛報道，引起轟動。原全國政協(xié)副主席、中國佛教協(xié)會會長趙樸初了解妙通塔出土文物的有關情況后，非常重視，住院期間欣然為“妙通塔”、“能仁寺”題寫了匾額。

妙通塔于1999年6月1日開工復建，2002年4月建成。復建的塔基直徑22米，塔高68.88米，塔總建筑面積1719平方米。地上七層，塔內置佛像68尊；地下一層為地宮，面積400平方米，用于宋代珍貴文物的展出。

能仁寺，于2004年8月復建，2007年10月建成。占地48.8畝，總建筑面積9645平方米。建筑布局規(guī)整，左右對稱。主要建筑分布在中軸線上，由南至北，依次是天王殿、妙通塔、大雄寶殿、臥佛殿、藏經樓、方丈樓。天王殿前是照壁，壁上嵌“慈航普渡”四個大字。山門（即天王殿正門）兩邊是能仁寺住持曙正法師親手題書的對聯(lián)：“童真入道安邦護國度群迷，菩薩化身輔正摧邪弘圣教”。門上方懸掛的“能仁寺”匾額，系已故中國佛協(xié)會長趙樸初題寫。寺院內，天王殿東側是鐘樓，西側是鼓樓。妙通塔東側有兩殿：南文殊殿，北觀音殿；西側有兩殿：南普賢殿，北地藏? ?。大雄寶殿東側是伽藍殿，西側是祖師殿。臥佛殿東側為興漣閣(系漣水縣佛協(xié)辦公處)。藏經樓東側是法堂，西側是講堂。方丈樓東側是戒堂，西側是律堂。寺院內西側有圍墻相隔的是生活區(qū)。