藥師殿供奉著一尊高1.6米的坐姿藥師佛像。藥師佛是梵文音譯，全稱是“藥師琉璃光如來”，亦名“醫(yī)王善逝”，“大醫(yī)王佛”。藥師殿坐落在崇圣寺上，崇圣寺的建于南詔時期，具體建造情況說法不一，《蒙段諸異僧》記載：“原崇圣寺初建于詔初，為詔王閣羅風(fēng)與吐蕃國師贊錯證盟處，為吐蕃使臣駐地。”

兩面藥師佛，頭頂為青色寶髻，雙耳垂肩，身穿華麗佛衣，跏趺安住蓮花臺上，面相慈善，儀態(tài)莊嚴(yán)。一面雙手作法界定印，一面雙手作施無畏手印，青色寶瓶放置其上，寶瓶中蓄滿甘露。整座佛像以紅色格調(diào)為主，配上花朵與祥云，金光閃閃，富貴華麗。日光菩薩、月光菩薩分侍左右，容光煥發(fā)，彩帶飄地，體態(tài)輕盈。

大理國內(nèi)史《大理國僧分五類》載：“蒙氏崇道敬佛，而于城西建八大寺、四道觀。其中最壯觀為崇圣寺，國師居寺中”。到了南詔勸豐祐時，重用海壽0師，法師獻(xiàn)策：“以南詔為佛國，重修崇圣寺為護(hù)國大崇圣寺”。另據(jù)《南詔野史》（胡本、王本）、《白古通記》等史籍記載，當(dāng)時崇圣寺與主塔建造時，寺基方7里，圣僧李成眉賢者建三塔，屋890，佛11400，銅40590斤，建于南詔第十主豐祐保和十年至天啟元年（公元834至840年），費工708000余，耗金銀布帛綾羅錦緞值金43514斤。

藥師殿是一座前三、后三、六耳的四合院殿宇。殿內(nèi)有云南山茶花兩株，相傳為元代蓮峰和尚手植。一株為“麻葉桃紅”，另外一株為“松子鱗”。這兩株云南山茶花，是昆明市園林局掛牌的古樹名木。“麻葉桃紅”于1983年枯死。晉寧人何作楫(字逖江)，曾詠《題盤龍山藥師院雙茶即贈臞仙、紀(jì)青昆玉》七言律詩一首。

按千尋塔座落在洱海沖積平原上，地基未見樁孔，塔身自重8000余噸，千余年經(jīng)多次強(qiáng)震仍巍然屹立，基礎(chǔ)的處理是成功的。

1994年10月，成立了崇圣寺三塔文物保護(hù)管理所，隨后又組建了三塔公園。在“建設(shè)民族文化大州”和“保護(hù)為主，搶救第一，有效保護(hù)，合理利用，加強(qiáng)管理”的方針指導(dǎo)下，省、州、市文化部門對三塔公園進(jìn)行科學(xué)規(guī)劃，自籌資金，投入8000多萬元恢復(fù)重建了歷史文化景觀，置寶鼎，銘三塔歷史，建三塔文物陳列館、夜景燈光工程、三塔聚影池、三塔苑酒店等。

經(jīng)南詔之后的大理國，佛教較南詔更為發(fā)展，有“佛國”“妙香國”之稱。崇圣寺建成之后即為南詔國、大理國時期佛教活動的中心。崇圣寺所崇之“圣”為觀音，當(dāng)時，大理地區(qū)對觀音崇拜極為勝行。大理國二十二代皇帝中，曾有九位到崇圣寺出家為僧。公元1056年，緬甸國王曾兩次來崇圣寺迎佛牙，大理皇帝段思廉在寺中以玉佛相贈。元武宗時曾“降圣旨”封釋覺性為住持僧，保護(hù)寺產(chǎn)，免征糧稅。元代亦曾加以維修，使得“殿廡煥然復(fù)興，三塔峙立，金碧交輝，巨麗與山埒（相等）”。

崇圣寺佛像以《宋時大理國畫工張勝溫畫倦梵像》等為藍(lán)本按大理多元文化、佛教禪宗密宗兼容的特色布局雕塑五百九十八尊件佛像法器，均用青銅燒鑄而成，除禪宗元祖和九位出國為僧的皇帝系凡人不貼金外，其馀五百七十四尊都貼金彩繪，建筑群落采用細(xì)白麻石和青草石進(jìn)行墻地面鋪貼和臺階踏步的支砌，柱礎(chǔ)佛臺均用大理石漢白玉，整個群落石料整齊劃一恢弘大氣，體現(xiàn)大理石文化特色。